Cell | 体细胞激活或抑制状态决定了核小体分离的差异性

2022-02-07 03:53:42 来源:
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细胞器在结构上通过促进或抑制作用该在结构上的mRNA可以操控等位测序的功能和细胞核身份认定。这些细胞器在结构上中亦会发挥作用特定的酪氨酸翻译后润色(posttranslational modifications,PTMs),它们与特定mRNA完全两者之间关,并可促进抑制作用性性染色体在结构上的过渡到,冲击等位基因的表达出来。为了在细胞核分裂时依然保持等位基因表达出来程序来的延续性,决定细胞器在结构上的分子特征也只能在子代细胞核中亦会建立。建立不尽相同一般来说细胞器完全的重要决定因素是酪氨酸PTMs,;大要发挥作用于酪氨酸H3和H4的翅膀上。因此,在细胞核分裂的每一次中亦会,除了DNA复制,表型核小体也只能重建,并扣除到子代细胞核中亦会。确实,实证见到表型的经典酪氨酸(比如复制依赖的酪氨酸)亦会在复制叉后迅速重新组装。不尽相同的实证组见到H3K9me3和H3K27me2/3可通过有丝分裂遗传。然而,这两个酪氨酸润色都是与抑制作用性细胞器在结构上两者之间关。那么,表型中亦会的核小体,以及它们携带的酪氨酸PTMs是否都能遗传到子代细胞核两者之间同的等位基因可容纳上呢?来自纽约大学兰戈恩该中亦会心的Danny Reinberg教授课题组在Cell发表实证Active and Repressed Chromatin Domains Exhibit Distinct Nucleosome Segregation during DNA Replication,该实证见到在DNA复制时,触发与受抑制作用细胞器范围的核小体转化是不尽相同的。受抑制作用细胞器在结构上中亦会的核小体亦会被迁移在子代细胞核两者之间同的等位基因范围,而触发型细胞器在结构上中亦会的核小体的扣除则是弥散和随机的。为实证核小体的转化情况,实证者在候选等位基因可容纳可逆标示酪氨酸H3.1和H3.2,以小鼠**核肿瘤中亦会核小体在细胞核分裂时的变动。比较简单来说,该方法通过邻近蛋白标示技术,并用CRISPR为特定等位基因可容纳的H3.1和H3.2手拿谷氨酸标示,经ChIP-qPCR侦测该谷氨酸标示在细胞核周期G1期和S期的稀土元素,以反应核小体的转化情况。若该位点H3.1和H3.2上的谷氨酸标示在一次细胞核分裂后增高一半,所述该核小体被迁移在了两个子代细胞核的两者之间同等位基因可容纳上;若该谷氨酸润色慢慢地消失,所述子代细胞核并未遗传该等位基因可容纳的核小体。实证者首先侦测了在**核肿瘤中亦会沉默表达出来的Hoxc6, Ebf1, Meis2等位基因的核小体转化情况。这些等位基因可容纳的核小体谷氨酸程度随细胞核分裂日益减至,这提示受抑制作用的等位基因可容纳的核小体亦会被迁移在子代细胞核的两者之间同一段距离。这与不足之处见到的H3K9me3和H3K27me2/3可通过有丝分裂遗传的周期性两者之间鲜为人知。那么,触发型细胞器范围的核小体又是如何转化的呢?实证者侦测了在**核肿瘤中亦会被触发表达出来的Ccna2, Nanog和Pou5f1等位基因,见到该等位基因可容纳的谷氨酸标示在细胞核分裂后呈弥散完全,稀土元素大大降低,这提示对于触发型细胞器范围来说,表型核小体很难精确的扣除到子代细胞核具体来说的等位基因可容纳,而是随机扣除的。更有趣的是,在可**母细胞核肿瘤分化时,Hoxc6等位基因由抑制作用转为触发,它的核小体扣除模式也由精确的同位点扣除改为随机扣除。这所述表型核小体的局部扣除,可以反映该细胞器范围的活性完全。总的来说,该实证通过CRISPR引导的酪氨酸谷氨酸标示系统,实证了核小体在细胞核分裂每一次中亦会的平方根,并见到触发与受抑制作用的细胞器范围的核小体平方根的不尽相同。值得注意的是,在细胞核周期的S近十年亦会,受抑制作用的细胞器范围的复制要晚于触发型细胞器范围。这个时间区别也导致常细胞器的复制频率大于奇异细胞器。奇异细胞器两者之间对很慢的复制速度显然保证了核小体的精确扣除,而常细胞器中亦会的PTMs则由具体来说的;大调节因子(master regulators)并不只能鉴别具体来说DNA序列,并招募PTMs酶重新建立。重构典故:Escobar TM1, Oksuz O1, Salda?a-Meyer R1, et al.Active and Repressed Chromatin Domains Exhibit Distinct Nucleosome Segregation during DNA Replication.Cell. 2019 Oct 31;179(4):953-963.e11. doi: 10.1016/j.cell.2019.10.009.
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